Năm 1984, xã Lê Chánh được thành lập trên cơ sở tách ấp Vĩnh Thạnh của xã Châu Phong và ấp Phú Hữu của xã Phú Vĩnh.[1] Xã Lê Chánh đặt theo tên của một cán bộ cộng sản hoạt động ở địa bàn Tân Châu, An Phú giai đoạn kháng chiến chống Mỹ.

Năm 1991, huyện Phú Châu chia lại thành hai huyện An Phú và Tân Châu, xã Lê Chánh thuộc huyện Tân Châu.

Năm 2009, một phần diện tích và dân số gồm 182 ha diện tích tự nhiên và 152 nhân khẩu của xã Lê Chánh được sáp nhập vào xã Phú Hiệp thuộc huyện Phú Tân. Xã Lê Chánh lúc này thuộc thị xã Tân Châu mới thành lập.[2]